RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	AK3	Q9UIJ7	227 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPTL7	O43827	346 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NRAS	P01111	189 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ADCYAP1	P18509	176 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CHAT	P28329	748 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CAV2	P51636	162 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	MST1L	Q2TV78	715 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	AAED1	Q7RTV5	226 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IL36G	Q9NZH8	169 aa		16.02	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	HTR5A	P47898	357 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GUCA2B	Q16661	112 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PRRX2	Q99811	253 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	BCO1	Q9HAY6	547 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP57	Q9NU63	452 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF716	A6NP11	495 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		H7C2Y5	167 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LRP3	O75074	770 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR3A	P08637	254 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF728	P0DKX0	622 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF32	P17041	273 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1A2	P50226	295 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FUT6	P51993	359 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PIGP	P57054	158 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT14	Q96FL9	552 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RHOF	Q9HBH0	211 aa		16.01	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GGN	Q86UU5	652 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OSR2	Q8N2R0	312 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	POM121	Q96HA1	1249 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	HRH4	Q9H3N8	390 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MED6	O75586	246 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT1	P15291	398 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR2C	P31995	323 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FOXB1	Q99853	325 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NAA60	Q9H7X0	242 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PARP11	Q9NR21	331 aa		16	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CER1	O95813	267 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PSG4	Q00888	419 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	HGFAC	Q04756	655 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LRTM2	Q8N967	370 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SYT3	Q9BQG1	590 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		E5RGE8	158 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OPRM1	P35372	400 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RRAD	P55042	308 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	F2RL1	P55085	397 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NSG2	Q9Y328	171 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP54	Q96N23	3096 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL13	O43927	109 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NTF4	P34130	210 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PMEL	P40967	661 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FAM3A	P98173	230 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SPEM2	Q0P670	501 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR8B8	Q15620	311 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR2A2	Q6IF42	318 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM40L	Q969M1	308 aa		15.98	■□□□□ 0.15

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