RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 COX7A1P24310 79 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ATP6AP1Q15904 470 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 AANATQ16613 207 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TMEM42Q69YG0 159 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 C12orf73Q69YU5 71 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 HCP5Q6MZN7 132 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 RORBQ92753 470 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PKIBQ9C010 78 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 DYNC1I1O14576 645 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SYT7O43581 403 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN15O95858 294 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SERPINA3P01011 423 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TK1P04183 234 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR2T7P0C7T2 308 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 FCGR1AP12314 374 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ODF4Q2M2E3 257 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CALHM1Q8IU99 346 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 C17orf50Q8WW18 174 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.41■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GTI1 187 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CCL3L1P16619 93 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 KIR2DS4P43632 304 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 IL24Q13007 206 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 HERPUD1Q15011 391 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 AP4S1Q9Y587 144 aa16.4■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CHRM2P08172 466 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 MPZP25189 248 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 EDDM3BP56851 147 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 HES4Q9HCC6 221 aa16.39■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 METTL15A6NJ78 407 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 H3BSH0 61 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 ARG1P05089 322 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CCL1P22362 96 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 EPHA2P29317 976 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 HTR1FP30939 366 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 BMXP51813 675 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 FUT6P51993 359 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 EFNB1P98172 346 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 COL10A1Q03692 680 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 ZNF273Q14593 569 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 RFKQ969G6 155 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 BORCS8Q96FH0 119 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CEP19Q96LK0 163 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 K7N7A8 449 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 SULT1C4O75897 302 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CYB5AP00167 134 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZSR3 168 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 SSX6Q7RTT6 188 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CATSPERDQ86XM0 798 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 CIB1Q99828 191 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 H3BUI4 141 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 PEX14O75381 377 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 ATP5HO75947 161 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 INMTO95050 263 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 APOL3O95236 402 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 OCM2P0CE71 109 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 ERVK11-1P61568 191 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 BNIP1Q12981 228 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 TMED1Q13445 227 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-212ENST00000484841 FAM189A2Q15884 450 aa16.36■□□□□ 0.21
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