RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL3P20749 454 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINA2P20848 420 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GALP22466 123 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PAX7P23759 505 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 COL8A2P25067 703 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP1P28562 367 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HAAOP46952 286 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NPBWR2P48146 333 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MTNR1BP49286 362 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZP1P60852 638 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF154Q13106 437 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 KISS1Q15726 138 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 EFNB3Q15768 340 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MLANAQ16655 118 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UTS2BQ765I0 119 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX8Q7RTT4 187 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF611Q8N823 705 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM104Q8NE00 496 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PP6455Q8WZ26 134 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PHYHIPQ92561 330 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 YIPF5Q969M3 257 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A28Q96A46 364 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SLITRK2Q9H156 845 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51I2Q9H344 312 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OPA3Q9H6K4 179 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CKLFQ9UBR5 152 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF391Q9UJN7 358 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 V9GY05 133 aa5.09□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GW55 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IFITM5A6NNB3 132 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 POM121CA8CG34 1229 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NOTOA8MTQ0 251 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf100A8MU93 164 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC17A2O00624 439 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD5O14737 125 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HPGDSO60760 199 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM4BO94953 1096 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MPIG6BO95866 241 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IL1AP01583 271 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SFTPBP07988 381 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PTHLHP12272 177 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKACBP22694 351 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR2CP28335 458 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX19P40855 299 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FUT6P51993 359 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP1B3P54709 279 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SELENOVP59797 346 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG3P63215 75 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB11BQ15907 218 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CARTPTQ16568 116 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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