RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 TIMM17BO60830 172 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 NOL3O60936 208 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 FKBP6O75344 327 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 KRT75O95678 551 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PAX6P26367 422 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 EVX1P49640 407 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 NPWQ8N729 165 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF283Q8N7M2 679 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR4C16Q8NGL9 310 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLDN23Q96B33 292 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ECHDC3Q96DC8 303 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 MTFP1Q9UDX5 166 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAB22AQ9UL26 194 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 HES2Q9Y543 173 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PNPLA6Q8IY17 1366 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.88□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLUHO75153 1309 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PAPPAQ13219 1627 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRDM2Q13029 1718 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CEP192Q8TEP8 1941 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A0G2JMM0 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PPB8 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PPE3 182 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PPM0 123 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PRS3 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 SYCE3A1L190 88 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 F5H5T6 163 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLPP1O14494 284 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 C8orf88P0DMB2 117 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 FUT1P19526 365 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTNP21246 168 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 KDELR1P24390 212 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCR7P32248 378 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 VHLP40337 213 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 HOXC5Q00444 222 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CD164Q04900 197 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 RPA4Q13156 261 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCDC80Q76M96 950 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF555Q8NEP9 628 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 KCNG3Q8TAE7 436 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 NAT6Q93015 286 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM131CQ96AQ9 280 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CATSPER2Q96P56 530 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR4K3Q96R72 315 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 OMDQ99983 421 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 MED4Q9NPJ6 270 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CES1P1Q9UKY3 287 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 JCADQ9P266 1359 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ATP10AO60312 1499 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 WDR97A6NE52 1622 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 MBD5Q9P267 1494 aa-0.9□□□□□ -2.55
RN7SKP19-201ENST00000516016 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms