RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PLPP3	O14495	311 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCD4	O14678	606 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	GPR37	O15354	613 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SOCS1	O15524	211 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SULT1A1	P50225	295 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002		F6UZH7	168 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	HP	P00738	406 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	HAAO	P46952	286 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	LIMK1	P53667	647 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CD200	P41217	278 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A087X0M5	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1B0GX30	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SPINT2	O43291	252 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	GRP	P07492	148 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	FUT6	P51993	359 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PDCD1	Q15116	288 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	EXTL1	Q92935	676 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PPE2	198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	MASP2	O00187	686 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	B4GALT1	P15291	398 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CCR5	P51681	352 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	EXT1	Q16394	746 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	DHRS3	O75911	302 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	NTF3	P20783	257 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	MICB	Q29980	383 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	HNF1A	P20823	631 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	H2BFS	P57053	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	NAAA	Q02083	359 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNAB3	O43448	404 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	ADAM20	O43506	726 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1W2PPC4	97 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	NPBWR1	P48145	328 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEGF6-205	ENST00000485002	SIRPB1	O00241	398 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CYR61	O00622	381 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	CXCL13	O43927	109 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PPP1CA	P62136	330 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	FUT7	Q11130	342 aa		13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	HRK	O00198	91 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	MPPED1	O15442	326 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	APOA2	P02652	100 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEGF6-205	ENST00000485002	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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