RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FCN3	O75636	299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MT-ND2	P03891	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GMFB	P60983	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PAX2	Q02962	417 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POC1A	Q8NBT0	407 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GPR148	Q8TDV2	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GHSR	Q92847	366 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PKIB	Q9C010	78 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RASL12	Q9NYN1	266 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ALX3	O95076	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PGA5	P0DJD9	388 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PCMT1	P22061	227 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PRKACB	P22694	351 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GLRA1	P23415	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PITPNB	P48739	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TAS2R43	P59537	309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GNB2	P62879	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IL24	Q13007	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	STUM	Q69YW2	141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BORCS8	Q96FH0	119 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF488	Q96MN9	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CCL13	Q99616	98 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NF1	P21359	2839 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR2AT4	A6NND4	320 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	AVP	P01185	164 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD1A	P06126	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GATA3	P23771	443 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SOX2	P48431	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RBP2	P50120	134 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NPY4R	P50391	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ATP1B3	P54709	279 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNF144B	Q7Z419	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SPSB1	Q96BD6	273 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR5M11	Q96RB7	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MND1	Q9BWT6	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A0G2JMP0	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A0X1KG70	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A1B0GW55	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		J3QLI3	93 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DVL1	O14640	695 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms