RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEK6Q9HC98 313 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIABLOQ9NR28 239 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL12A1Q99715 3063 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PQLC2LA1A4F0 135 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 A1L4Q6 167 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF732B4DXR9 585 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 XRCC3O43542 346 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN1O95832 211 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINF1P36955 418 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RANBP1P43487 201 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 INPP1P49441 399 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS2R20P59543 309 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASAH1Q13510 395 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR13G1Q8NGZ3 307 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHF21AQ96BD5 680 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 LANCL1O43813 399 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MNDAP41218 407 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALDH3B1P43353 468 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DGCR2P98153 550 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKPD1Q17RQ9 610 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM63Q969Q1 353 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLSCR5A0PG75 271 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM4BO94953 1096 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 VSIG8P0DPA2 414 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB6AP20340 208 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP1B3P54709 279 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 QRFPP83859 136 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDPD3Q7L5L3 318 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A4Q9H015 551 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB22AQ9UL26 194 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ICE1Q9Y2F5 2266 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ROS1P08922 2347 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLA2G10O15496 165 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPPPO94811 219 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 YIPF5Q969M3 257 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAL3ST1Q99999 423 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MICU1Q9BPX6 476 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPOCK3Q9BQ16 436 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTL8AQ9BWD3 113 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1B0GWJ7 208 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 A6NNC1 897 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 F5H5P2 479 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLATP00750 562 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC119Q13432 240 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CALHM1Q8IU99 346 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2Z1Q8NG97 314 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 C15orf40Q8WUR7 153 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMIM4Q8WVI0 70 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS9Q9BPW9 319 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPR1 153 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5B21A6NL26 309 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD3GP09693 182 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAT2P11245 290 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGFRP43088 359 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZP1P60852 638 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNG3P63215 75 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR86Q86TI4 376 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM46BQ96A09 425 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBLN5Q9UBX5 448 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM14DPA8MWL7 114 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SSX4O60224 188 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPNP16150 400 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAAOP46952 286 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPRY3O43610 288 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBBP0CG47 229 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTHLHP12272 177 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF81P51508 661 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MST1LQ2TV78 715 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 HACD4Q5VWC8 232 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2W3Q7Z3T1 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAV18A0A075B6X5 111 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABARAPH6UMI1 98 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFX2P48378 723 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAB21L1Q13394 359 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRARPQ7Z6K4 114 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ING4Q9UNL4 249 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL21EPA6NDL7 271 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM225BP0DP42 221 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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