RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.6■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 PLPP2O43688 288 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZNF12P17014 697 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 GABARAPL2P60520 117 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZNF154Q13106 437 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 SPHARQ15513 63 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 OR5A2Q8NGI9 324 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 OR51F2Q8NH61 342 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ERGIC1Q969X5 290 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 RNF170Q96K19 258 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 MICU1Q9BPX6 476 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 ABCB9Q9NP78 766 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.59■□□□□ 0.09
PUF60-218ENST00000531995 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF732B4DXR9 585 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CD1AP06126 327 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 BDH1Q02338 343 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 FAM201AQ5SY85 155 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 C12orf54Q6X4T0 127 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 OR51I2Q9H344 312 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.58■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CLDN25C9JDP6 229 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 C3orf80F5H4A9 247 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 LHBP01229 141 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 IGHV2-70P01814 119 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 GPM6AP51674 278 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ACTG1P63261 375 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 MZT1Q08AG7 82 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 SPARTQ8N0X7 666 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CHST5Q9GZS9 411 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 FN3KRPQ9HA64 309 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 NPTNQ9Y639 398 aa15.57■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TMEM210A6NLX4 147 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 IFNL4K9M1U5 179 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CDIPTO14735 213 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CELP19835 753 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TAS2R43P59537 309 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 LMO4P61968 165 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 GNG3P63215 75 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 MED22Q15528 200 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 WDR82Q6UXN9 313 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 UTS2BQ765I0 119 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 RNF144BQ7Z419 303 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 GPR148Q8TDV2 347 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PP6455Q8WZ26 134 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.56■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 WNK2Q9Y3S1 2297 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 OR5B21A6NL26 309 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF205O95201 554 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 EGR1P18146 543 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ATF1P18846 271 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CFPP27918 469 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 CFHR2P36980 270 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 SOX2P48431 317 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TPBGQ13641 420 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZMYND11Q15326 602 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF529Q6P280 563 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 OPALINQ96PE5 141 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TMEM165Q9HC07 324 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 RNF7Q9UBF6 113 aa15.55■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 A6NLC8 198 aa15.54■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PUF60-218ENST00000531995 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms