RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LMO4P61968 165 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR50Q13585 617 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 MED22Q15528 200 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2V2Q15819 145 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF404Q494X3 552 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 BORCS8Q96FH0 119 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM165Q9HC07 324 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 MIOXQ9UGB7 285 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-212ENST00000508338 OOEPA6NGQ2 149 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 B4DSR2 109 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 J3QT63 122 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LMX1BO60663 402 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV2-5P01817 119 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ATF1P18846 271 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CELP19835 753 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 RBP2P50120 134 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 PKIBQ9C010 78 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 SRRM5B3KS81 715 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 WNT9BO14905 357 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 HAAOP46952 286 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP1B3P54709 279 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MICBQ29980 383 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX36Q5VZQ5 186 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 SVOPQ8N4V2 548 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MS4A15Q8N5U1 240 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 AQP3Q92482 292 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 SGCDQ92629 289 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 PGLYRP3Q96LB9 341 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 RASL12Q9NYN1 266 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LY6G6DO95868 133 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MPZP25189 248 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 Q499Y3 187 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM106AQ96A25 262 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OPALINQ96PE5 141 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 SULT1B1O43704 296 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 IL24Q13007 206 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP41Q8N8Y5 198 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 UFD1Q92890 307 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5M11Q96RB7 305 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CKLFQ9UBR5 152 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC42Q9Y546 428 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEB3O15480 346 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB5AP00167 134 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP2-212ENST00000508338 PCMT1P22061 227 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 IL2RGP31785 369 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM166AQ6J272 317 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51F2Q8NH61 342 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ZANQ9Y493 2812 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXH1O75593 365 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 SOX2P48431 317 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 MTCP1P56278 107 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP3R1P63098 170 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAM1Q15629 374 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM90A1Q86YD7 464 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 POC1AQ8NBT0 407 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8B2Q96RD0 313 aa22.46■■□□□ 1.19
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