RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 J3QT63 122 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CDIPTO14735 213 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NDUFS7O75251 213 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LY6HO94772 140 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 INMTO95050 263 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ALX3O95076 343 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PLATP00750 562 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MAS1P04201 325 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CD36P16671 472 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 FSTP19883 344 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GALP22466 123 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 THBS2P35442 1172 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 POU3F4P49335 361 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PSMD7P51665 324 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF154Q13106 437 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MAB21L1Q13394 359 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 UBE2V2Q15819 145 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 KRT74Q7RTS7 529 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GPR141Q7Z602 305 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 Q8IYB0 196 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 Q8TCH9 128 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LRRC29Q8WV35 223 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MUL1Q969V5 352 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 DERL3Q96Q80 235 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PKIBQ9C010 78 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NOX4Q9NPH5 578 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GLS2Q9UI32 602 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 STUB1Q9UNE7 303 aa9.05□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PLCE1Q9P212 2302 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TRIM64BA6NI03 449 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PPIAL4DF5H284 164 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GABRPO00591 440 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM225BP0DP42 221 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LYNX1P0DP58 116 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GLRA1P23415 457 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 COL8A2P25067 703 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 BTG1P62324 171 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MICBQ29980 383 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SPICQ8N5J4 248 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 Q96MF0 132 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GAL3ST1Q99999 423 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.04□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM178BH3BS89 294 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NXPH2O95156 264 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 ALDOBP05062 364 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SRMP19623 302 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 BMXP51813 675 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 FABP5Q01469 135 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 IL24Q13007 206 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RSU1Q15404 277 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 KISS1Q15726 138 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 MPPED2Q15777 294 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 YIPF5Q969M3 257 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RAB39BQ96DA2 213 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 KCTD7Q96MP8 289 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 OR51I2Q9H344 312 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.03□□□□□ -0.96
SAR1B-202ENST00000439578 RASL12Q9NYN1 266 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms