RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ICOSLGO75144 302 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C1QCP02747 245 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A1P53007 311 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 IL21Q9HBE4 155 aa8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 RUNX2Q13950 521 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PDCD1Q15116 288 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 THEM4Q5T1C6 240 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LAT2Q9GZY6 243 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PNR3 127 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF732B4DXR9 585 aa8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF253O75346 499 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PGA3P0DJD8 388 aa8.77□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 EDDM3BP56851 147 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ARL16Q0P5N6 197 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CER1O95813 267 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-9P01782 118 aa8.76□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OSR2Q8N2R0 312 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MARCH5Q9NX47 278 aa8.76□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 MRGPREQ86SM8 312 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC35E1Q96K37 410 aa8.76□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 PIAS2O75928 621 aa8.76□□□□□ -1.01
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HERC3-202ENST00000402738 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TRIB1Q96RU8 372 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 M0R2Z0 102 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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