RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ALX3O95076 343 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 TGFBR1P36897 503 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 MTNR1BP49286 362 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 SELENOVP59797 346 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 OR8G5Q8NG78 346 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GWJ7 208 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 LYNX1G3V0Z9 82 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 LYNX1P0DP58 116 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 MYL9P24844 172 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 UBE2V2Q15819 145 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 OR5AS1Q8N127 324 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 OR13C9Q8NGT0 318 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 TECTBQ96PL2 329 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 SLITRK2Q9H156 845 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.46■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 A0A1W2PPW3 197 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SULT1B1O43704 296 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NRASP01111 189 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NAT2P11245 290 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 RAB3AP20336 220 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SDC2P34741 201 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MMP15P51511 669 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PPP3R1P63098 170 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PRDX4Q13162 271 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 RIN1Q13671 783 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MOGQ16653 247 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CYB5R2Q6BCY4 276 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 USP43Q70EL4 1123 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 TPRA1Q86W33 373 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 OR1M1Q8NGA1 313 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PIGCQ92535 297 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A4Q9H015 551 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 COL6A5A8TX70 2615 aa15.45■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 IL1AP01583 271 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 HPXP02790 462 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ADRA2CP18825 462 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ATF1P18846 271 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SPCS2Q15005 226 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZR03 302 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SPSB1Q96BD6 273 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ABCB9Q9NP78 766 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 GPR173Q9NS66 373 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 GPR160Q9UJ42 338 aa15.44■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MEGF11A6BM72 1044 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NCR1O76036 304 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CDRT1O95170 752 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CA6P23280 308 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 SERPINB10P48595 397 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 GZMKP49863 264 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 OR13G1Q8NGZ3 307 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NDNFQ8TB73 568 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ITPKCQ96DU7 683 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 TMEM100Q9NV29 134 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PDCD5O14737 125 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MAS1P04201 325 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ALDOBP05062 364 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CD37P11049 281 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 BDKRB2P30411 391 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 CEP78Q5JTW2 689 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 MOB3CQ70IA8 216 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 DNAAF1Q8NEP3 725 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 GFI1Q99684 422 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NEK6Q9HC98 313 aa15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 PLSCR5A0PG75 271 aa15.42■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 LRP5LA4QPB2 252 aa15.42■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.42■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.42■□□□□ 0.06
PTX4-201ENST00000293922 C17orf100A8MU93 164 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms