RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GALP22466 123 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 THBS2P35442 1172 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPM6AP51674 278 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PPP3R1P63098 170 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CCL8P80075 99 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPR107Q5VW38 600 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 UTS2BQ765I0 119 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SATL1Q86VE3 508 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SPERTQ8NA61 448 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RNF170Q96K19 258 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TECTBQ96PL2 329 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR2V2Q96R30 315 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MICU1Q9BPX6 476 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SLITRK2Q9H156 845 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DECR2Q9NUI1 292 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA1DQ01668 2161 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ROS1P08922 2347 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 APCP25054 2843 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR5B21A6NL26 309 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OVOL3O00110 214 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEB3O15480 346 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NCR1O76036 304 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GRPP07492 148 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD55P08174 381 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ADH4P08319 380 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SRMP19623 302 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PRKACBP22694 351 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MYL9P24844 172 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 BDKRB2P30411 391 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD200P41217 278 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FUT6P51993 359 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MZT1Q08AG7 82 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MAB21L1Q13394 359 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TESK1Q15569 626 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SPRNQ5BIV9 151 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FAM209AQ5JX71 171 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF529Q6P280 563 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PHYHIPQ92561 330 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 BORCS8Q96FH0 119 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SPACA5Q96QH8 159 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CENPOQ9BU64 300 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NEK6Q9HC98 313 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IL19Q9UHD0 177 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 EDARQ9UNE0 448 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DYSFO75923 2080 aa7.21□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 A6NLC8 198 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM210A6NLX4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LY6HO94772 140 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PLATP00750 562 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HPXP02790 462 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF1AP19438 455 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DNASE1P24855 282 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TGFBR1P36897 503 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HAAOP46952 286 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RBP2P50120 134 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ATP1B3P54709 279 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MTCP1P56278 107 aa7.21□□□□□ -1.26
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