RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFXN3Q9BWM7 321 aa25.13■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CST4P01036 141 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 MELTFP08582 738 aa25.12■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV3-15P01624 115 aa25.11■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPRMLQ8N4K4 120 aa25.1■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF170Q96K19 258 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 TM2D1Q9BX74 207 aa25.09■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM229BQ8NBD8 167 aa25.08■■□□□ 1.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT15Q9NV35 164 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5H1A6NKK0 313 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOCS1O15524 211 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSTBP04080 98 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNB3P16520 340 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDZK1IP1Q13113 114 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEACAM21Q3KPI0 293 aa25.06■■□□□ 1.6
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