RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0J9YX75 114 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT87PA6NCN2 255 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A6NED7 52 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA8SH3BPF8 625 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLA2G10O15496 165 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN12O95859 305 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT-ND3P03897 115 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTHLHP12272 177 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRABP2P29373 138 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCK1P35558 622 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MDH1P40925 334 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ART3Q13508 389 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPIN4Q56A73 249 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNSTQ6PJW8 725 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZDHHC22Q8N966 263 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZIC4Q8N9L1 334 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBAC2Q8NBM4 344 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC29A1Q99808 456 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UQCC2Q9BRT2 126 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM21Q9BVV7 248 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51M1Q9H341 326 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGALS13Q9UHV8 139 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.64□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0G2JMP0 313 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0J9YYE9 177 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0X1KG70 313 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GVG6 124 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYRM9A8MSI8 78 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB5O15062 677 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSPHP1O15172 72 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBC1P01850 177 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL10P22301 178 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNA8P32881 189 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFN2P35080 140 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPICP45877 212 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR4P46093 362 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGFBIQ15582 683 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCL2A1Q16548 175 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NADK2Q4G0N4 442 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZYG11AQ6WRX3 759 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRNTQ86SH4 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF555Q8NEP9 628 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFCQ8NFQ6 507 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10P1Q8NGE3 313 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGARPQ8TDB4 240 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGTBQ96EQ0 304 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFT74Q96LB3 600 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PORCNQ9H237 461 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRO2289Q9P1D8 64 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKNAQ7Z591 1439 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUP205Q92621 2012 aa-0.65□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCTP09848 1927 aa-0.66□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GWJ7 208 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A6NDN8 102 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F5H5P2 479 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EQM0 130 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TP53I11O14683 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAPPC3O43617 180 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN11O75508 207 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAP43P17677 238 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRG2P18507 467 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS3P35030 304 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACLYP53396 1101 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC61GP60059 68 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGL1Q08830 312 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNXAQ16473 311 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MLIPQ5VWP3 458 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC93AQ86WB7 457 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF738Q8NE65 137 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5AR1Q8NGP9 310 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN23Q96B33 292 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDIT4LQ96D03 193 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE2E2Q96LR5 201 aa-0.66□□□□□ -2.52
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