RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF879B4DU55 563 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 H0YL77 283 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 H7C417 338 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OVOL3O00110 214 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 MLNRO43193 412 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 GMDSO60547 372 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 NRASP01111 189 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 IGHV1-46P01743 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 HLA-DPB1P04440 258 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ADH4P08319 380 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 GABRA5P31644 462 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CDKN1AP38936 164 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 MAGEB1P43366 347 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 MZT1Q08AG7 82 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SSX1Q16384 188 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 Q499Y3 187 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 KRT74Q7RTS7 529 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SPERTQ8NA61 448 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 PP6455Q8WZ26 134 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 LURAP1Q96LR2 239 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OR14A2Q96R54 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 MICU1Q9BPX6 476 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CHST5Q9GZS9 411 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 GPR173Q9NS66 373 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 DECR2Q9NUI1 292 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 DSCAMO60469 2012 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CENPEQ02224 2701 aa7.2□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 AKAP6Q13023 2319 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1B0GWJ7 208 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 F5H5P2 479 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 H3BS24 57 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 RGS13O14921 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CD55P08174 381 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CD36P16671 472 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ATF1P18846 271 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 PPP3R1P63098 170 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TESK1Q15569 626 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CEP78Q5JTW2 689 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 FAM209AQ5JX71 171 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM42Q69YG0 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 UTS2BQ765I0 119 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CDH24Q86UP0 819 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM106AQ96A25 262 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 RNF170Q96K19 258 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TECTBQ96PL2 329 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 DERL3Q96Q80 235 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 NEK6Q9HC98 313 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CKLFQ9UBR5 152 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SCOCQ9UIL1 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.19□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 SPG11Q96JI7 2443 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 CACNA1DQ01668 2161 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1W2PPK0 400 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 OR5B21A6NL26 309 aa7.18□□□□□ -1.26
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF732B4DXR9 585 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms