RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPB2Q16082 182 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AVPI1Q5T686 147 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPN5Q6U736 354 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM229BQ8NBD8 167 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM104Q8NE00 496 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB27BO00194 218 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMS2P2O95744 297 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPP00738 406 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCKP08631 526 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM6P0DI80 62 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLSTP36957 453 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MECP2P51608 486 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAND1P57086 179 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3AR1Q16581 482 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDCP2Q5VXM1 449 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf198Q9H425 327 aa13.65□□□□□ -0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEGF11A6BM72 1044 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM166BA8MTA8 275 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHG1P01857 330 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNA6P05013 189 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF735P0CB33 412 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LUMP51884 338 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1B3P54709 279 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLF1P58340 268 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL13RA1P78552 427 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSC22D1Q15714 1073 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM57BQ71RH2 274 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FADS6Q8N9I5 356 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM206AQ9NX38 181 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD9Q9P000 198 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACP1P24666 158 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR3A4PP47883 348 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A9P48067 706 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR13Q9H1Z4 485 aa13.64□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C5orf51A6NDU8 294 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHODHQ02127 395 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR84Q9NQS5 396 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCL13O43927 109 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHMP01871 453 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFA6Q01524 100 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAXDQ8IW45 347 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF138Q8WVD3 245 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.63□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2AT4A6NND4 320 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOCS1O15524 211 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSTP19883 344 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXT1Q16394 746 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDEM2Q9BV94 578 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMSDA8MTL9 139 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WRBO00258 174 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P04436 131 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFB7P17568 137 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGA3P26006 1051 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDF1P27539 372 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSX1P28360 303 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPY4RP50391 375 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPT1P50897 306 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZP4Q12836 540 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BATF2Q8N1L9 274 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAQR8Q8TEZ7 354 aa13.62□□□□□ -0.23
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms