RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157		H0YIG0	161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	TNFRSF10C	O14798	259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	PRH1	P02810	166 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	FABP4	P15090	132 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GFER	P55789	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RHEB	Q15382	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SGCB	Q16585	318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	PDE7B	Q9NP56	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	LRP3	O75074	770 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	DCAF10	Q5QP82	559 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL12	A8MUP2	240 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB27B	O00194	218 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNDC12	O95881	172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	IL11	P20809	199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	LMX1A	Q8TE12	382 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RLN3	Q8WXF3	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157		A8MVM7	634 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	WISP1	O95388	367 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB6A	P20340	208 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	TNFRSF4	P43489	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RABIF	P47224	123 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC6A9	P48067	706 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	FOXL2	P58012	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	TAS2R31	P59538	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPB2	Q16082	182 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC6	Q99741	560 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	EFS	O43281	561 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	IL18BP	O95998	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	BGLAP	P02818	100 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	GLI4	P10075	376 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC37A1	P57057	533 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	DMWD	Q09019	674 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSUH2-208	ENST00000455157	MR1	Q95460	341 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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