RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 FGF7P21781 194 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVFC1-1P60608 527 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1CBP62140 327 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 UQCC3Q6UW78 93 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 GALMQ96C23 342 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST6Q9GZX3 395 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WUJ7 227 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7A2P2O60397 106 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB6O95139 128 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CST4P01036 141 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCD3P28288 659 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TPPP2P59282 170 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TAAR6Q96RI8 345 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PROCRQ9UNN8 238 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN12O95859 305 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 KRASP01116 189 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 GP1BAP07359 652 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF1P18846 271 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ3P48549 501 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FUT6P51993 359 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SPSB1Q96BD6 273 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 EDEM2Q9BV94 578 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN34H7C241 214 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 OTOSQ8NHW6 89 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 HES4Q9HCC6 221 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SNCGO76070 127 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 THBS4P35443 961 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 RAG2P55895 527 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SP6Q3SY56 376 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 EXTL1Q92935 676 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 WBP2Q969T9 261 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 VAMP8Q9BV40 100 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXQ1Q9C009 403 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FRG2CA6NGY1 282 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CBR3O75828 277 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 HPP00738 406 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC37A1P57057 533 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FA2HQ7L5A8 372 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1DO15297 605 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 EMDP50402 254 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 GFERP55789 205 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXF1Q12946 379 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 MIDNQ504T8 468 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf73Q69YU5 71 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF429Q86V71 674 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 ACY3Q96HD9 319 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC3P53804 2025 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PGA3P0DJD8 388 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CCKARP32238 428 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 CCR5P51681 352 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM3AP98173 230 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 NKG7Q16617 165 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-202ENST00000426333 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms