RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 PGA3P0DJD8 388 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 EVX1P49640 407 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CLDN17P56750 224 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 THRSPQ92748 146 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A28Q96A46 364 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CENPMQ9NSP4 180 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ADCYAP1P18509 176 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NDUFA6P56556 154 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CLDN12P56749 244 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SLC35A1P78382 337 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 MZT2AQ6P582 158 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 OXGR1Q96P68 337 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CLCC1Q96S66 551 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 GFI1Q99684 422 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ITGB1BP1O14713 200 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 TCRBP04435 133 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 EPXP11678 715 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CPT2P23786 658 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 AP3S2P59780 193 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 H3F3AP84243 136 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 OR52N5Q8NH56 324 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM106AQ96A25 262 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 C4orf45Q96LM5 186 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CA11O75493 328 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NEURL1O76050 574 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 IGHG1P01857 330 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 Q499Y3 187 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 PRSS33Q8NF86 280 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 RAB24Q969Q5 203 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PR64 198 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PRV1 198 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 IGHV2-5P01817 119 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 HPXP02790 462 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CD1AP06126 327 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 CNR1P21554 472 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 GDF1P27539 372 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SERPINF1P36955 418 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ZP1P60852 638 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 PLA1AQ53H76 456 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 MCHR2Q969V1 340 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PPQ1 181 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 A6NLC8 198 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 PRR33A8MZF0 331 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 G3V3Q6 166 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 PMS2P2O95744 297 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SRD5A2P31213 254 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 VASH2Q86V25 355 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 RNF128Q8TEB7 428 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ISOC2Q96AB3 205 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 AKAP13Q12802 2813 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 MGAQ8IWI9 3026 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF726A6NNF4 738 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM238C9JI98 176 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 LANCL1O43813 399 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 MAS1P04201 325 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf106-201ENST00000316786 ROM1Q03395 351 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms