RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM106AQ96A25 262 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 RNF170Q96K19 258 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GPR173Q9NS66 373 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG2Q9Y698 323 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CDC14BO60729 498 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SC5DO75845 299 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 LYNX1P0DP58 116 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SOX2P48431 317 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 RIN1Q13671 783 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TRAM1Q15629 374 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MPPED2Q15777 294 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 HFEQ30201 348 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF529Q6P280 563 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FAM168AQ92567 244 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 LRP5LA4QPB2 252 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 VWC2LB2RUY7 222 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF879B4DU55 563 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF732B4DXR9 585 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 INMTO95050 263 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ATF1P18846 271 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FSTP19883 344 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PMELP40967 661 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GPM6AP51674 278 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FUT6P51993 359 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM33P57088 247 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SSX1Q16384 188 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CCL17Q92583 94 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 HPS1Q92902 700 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SPSB1Q96BD6 273 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DERL3Q96Q80 235 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR14A2Q96R54 314 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR51I2Q9H344 312 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ITPR3Q14573 2671 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CR1P17927 2039 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CLDN25C9JDP6 229 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CCRL2O00421 344 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1B1O43704 296 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GPX5O75715 221 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GRPP07492 148 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A16P16260 332 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PRKACBP22694 351 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB9P28065 219 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GABRA5P31644 462 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CFHR2P36980 270 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MUL1Q969V5 352 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TMED9Q9BVK6 235 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 VPS13CQ709C8 3753 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MAST4O15021 2626 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 A6NLC8 198 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC30A6NM36 301 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM178BH3BS89 294 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PIN1P1O15428 100 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 FSTL3O95633 263 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM18P0DKX4 95 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 RAB3AP20336 220 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MPZP25189 248 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms