RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm16368A0A1Y7VNG9 144 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm43191F6YIH5 235 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plscr5J3QM92 274 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21812J3QN84 227 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ly6fP35460 134 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Egfbp2P36368 261 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GipP48756 144 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PmchP56942 165 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prrx1P63013 245 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gdf3Q07104 366 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sec14l3Q5SQ27 401 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cacfd1Q8BG21 171 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1270Q8VGP3 304 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ca15Q99N23 324 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ca7Q9ERQ8 264 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r96E9PZU5 664 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Itgb2P11835 771 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fgf2P15655 154 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clpsl2Q3UW21 102 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cnrip1Q5M8N0 164 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wdr34Q5U4F6 535 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fads6Q80UG1 342 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q80Y39 304 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Henmt1Q8CAE2 395 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr994Q8VF73 314 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnaja3Q99M87 480 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9CWB7 115 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Raet1eQ9CZQ6 251 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slco1a4Q9EP96 670 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RfxankQ9Z205 269 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MgmtP26187 211 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 S100a3P62818 101 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P2rx3Q3UR32 397 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp273Q7M6W8 501 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp85Q7TMC9 473 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc75aQ7TSF4 339 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gabarapl1Q8R3R8 117 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DhrsxQ8VBZ0 335 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Naa40Q8VE10 237 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gkn3Q9D0T7 191 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4933407L21RikQ9D476 131 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9D9C7 252 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dock2Q8C3J5 1828 aa9.9□□□□□ -0.82
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r224E9PWK2 298 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm9972E9Q053 102 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr936J3KMV2 267 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Foxd2O35392 492 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CebpgP53568 150 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc22a20Q80UJ1 556 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrtm2Q8BGX3 370 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1272Q8VGN8 308 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zcchc14Q8VIG0 956 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr73Q920P2 313 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Art4Q9CRA0 300 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ropn1lQ9EQ00 218 aa9.9□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cisd3B1AR13 137 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trabd2bB1ATG9 517 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Irs3O54718 495 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gnb1P62874 340 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Itgb2lQ3UV74 738 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il15raQ60819 263 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Uts2bQ765I1 113 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rph3alQ768S4 302 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpatch2Q7TQC7 527 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SynbQ8BI41 618 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr786Q8VFH8 312 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Asb9Q91ZT8 290 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700020A23RikQ9DA59 131 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slco1b2Q9JJL3 689 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv6-20A0A140T8P2 115 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr721-ps1A0A140T8T9 324 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm20489A2AGH5 449 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1410E9PYK6 323 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Socs1O35716 212 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnmt3bO88509 859 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccl20O89093 97 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cks2P56390 79 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccr8P56484 353 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ikzf1Q03267 517 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LipnQ3U4B4 400 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sez6Q7TSK2 991 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acaa2Q8BWT1 397 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PigwQ8C398 503 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr307Q8VFN8 313 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Med29Q9DB91 199 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930435E12RikA6X8Z9 381 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dpy19l1A6X919 746 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Skint2A7XUX6 400 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zbtb25G3UW50 439 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PhyhO35386 338 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr27O54897 379 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tpi1P17751 299 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rab19P35294 217 aa9.89□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rab1AP62821 205 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms