Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF4

Lrrc75a, Leucine-rich repeat-containing protein 75A, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc75aQ7TSF4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc75aQ7TSF4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc75aQ7TSF4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc75aQ7TSF4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc75aQ7TSF4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc75aQ7TSF4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc75aQ7TSF4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrc75aQ7TSF4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc75aQ7TSF4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc75aQ7TSF4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc75aQ7TSF4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc75aQ7TSF4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrc75aQ7TSF4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc75aQ7TSF4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc75aQ7TSF4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc75aQ7TSF4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc75aQ7TSF4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc75aQ7TSF4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc75aQ7TSF4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc75aQ7TSF4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc75aQ7TSF4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc75aQ7TSF4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc75aQ7TSF4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc75aQ7TSF4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc75aQ7TSF4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc75aQ7TSF4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc75aQ7TSF4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc75aQ7TSF4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc75aQ7TSF4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc75aQ7TSF4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc75aQ7TSF4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc75aQ7TSF4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc75aQ7TSF4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc75aQ7TSF4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc75aQ7TSF4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc75aQ7TSF4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc75aQ7TSF4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc75aQ7TSF4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc75aQ7TSF4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc75aQ7TSF4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc75aQ7TSF4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc75aQ7TSF4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc75aQ7TSF4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc75aQ7TSF4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc75aQ7TSF4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc75aQ7TSF4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc75aQ7TSF4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc75aQ7TSF4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc75aQ7TSF4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc75aQ7TSF4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc75aQ7TSF4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc75aQ7TSF4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc75aQ7TSF4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc75aQ7TSF4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc75aQ7TSF4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc75aQ7TSF4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc75aQ7TSF4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc75aQ7TSF4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc75aQ7TSF4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc75aQ7TSF4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc75aQ7TSF4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc75aQ7TSF4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc75aQ7TSF4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc75aQ7TSF4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc75aQ7TSF4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc75aQ7TSF4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc75aQ7TSF4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc75aQ7TSF4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc75aQ7TSF4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc75aQ7TSF4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc75aQ7TSF4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc75aQ7TSF4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc75aQ7TSF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc75aQ7TSF4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc75aQ7TSF4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc75aQ7TSF4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc75aQ7TSF4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc75aQ7TSF4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc75aQ7TSF4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc75aQ7TSF4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc75aQ7TSF4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc75aQ7TSF4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc75aQ7TSF4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc75aQ7TSF4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc75aQ7TSF4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc75aQ7TSF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc75aQ7TSF4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc75aQ7TSF4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc75aQ7TSF4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms