RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 INMTO95050 263 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 HNF1AP20823 631 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ANOS1P23352 680 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINF1P36955 418 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 LIPAP38571 399 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GSK3AP49840 483 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 FABP6P51161 128 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DOC2BQ14184 412 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SGMS2Q8NHU3 365 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR148Q8TDV2 347 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 LYZL4Q96KX0 146 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PLK3Q9H4B4 646 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNS2Q9ULS6 477 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 V9GYS6 101 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 B9A039 149 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CCRL2O00421 344 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINA3P01011 423 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MPV17P39210 176 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PSG7Q13046 419 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CYSLTR2Q9NS75 346 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CD300LBA8K4G0 201 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TCF21O43680 179 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRA5P31644 462 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TTKP33981 857 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GP2P55259 537 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ODF4Q2M2E3 257 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMAT1Q5H9K5 638 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 AGAP6Q5VW22 663 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM166AQ6J272 317 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT74Q7RTS7 529 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC22A4Q9H015 551 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCB9Q9NP78 766 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP13Q9UII6 198 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CD2P06729 351 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 GZMKP49863 264 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MSMPQ1L6U9 139 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MUC15Q8N387 334 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 OR56B2PQ8NGI1 322 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 CHODLQ9H9P2 273 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA1Q9HB21 404 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 DHDHQ9UQ10 334 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCE1Q9P212 2302 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPW3 197 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 USF1P22415 310 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GALP22466 123 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2T2Q6IF00 324 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RDH10Q8IZV5 341 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8G5Q8NG78 346 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PHYHIPQ92561 330 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT3Q9BQG1 590 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CBLN4Q9NTU7 201 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PLSCR5A0PG75 271 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 HLA-DPB1P04440 258 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 BMP4P12644 408 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SSX1Q16384 188 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 Q499Y3 187 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 PP6455Q8WZ26 134 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM168AQ92567 244 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf159Q96HA4 380 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TAAR3PQ9P1P4 343 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 FZR1Q9UM11 496 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 CST4P01036 141 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 TFAP2AP05549 437 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 OCM2P0CE71 109 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH3B2P48448 385 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP11Q86VZ4 500 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF525Q8N782 197 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.7 ms