RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CA14Q9ULX7 337 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 DHHO43323 396 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR2A4O95047 310 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CRYBA1P05813 215 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 GUSBP08236 651 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 IFI6P09912 130 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 OR51H1Q8NH63 302 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 BORCS7Q96B45 105 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CMBLQ96DG6 245 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR2A7Q96R45 310 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ACTL6BO94805 426 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 PTGFRP43088 359 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 KISS1Q15726 138 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 CDC14BO60729 498 aa9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 OTPQ5XKR4 325 aa9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
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PTPRM-205ENST00000577827 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRM-205ENST00000577827 HSPB6O14558 160 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TNFSF14O43557 240 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 FGF2P09038 288 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 FUT6P51993 359 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR6C1Q96RD1 312 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 RNF4P78317 190 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 REEP6Q96HR9 211 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-205ENST00000577827 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 MPTX1A8MV57 137 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 DEGS1O15121 323 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAHP16930 419 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RANP62826 216 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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