RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 PKP2Q99959 881 aa14.64□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.64□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.64□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.64□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MMP9P14780 707 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ALOX5APP20292 161 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 GALNT4Q8N4A0 578 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 RNF170Q96K19 258 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 NIPAL2Q9H841 368 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.63□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CCDC182A6NF36 153 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CLDN34H7C241 214 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 AKR7A2O43488 359 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TFF1P04155 84 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 OMGP23515 440 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 DAPP51397 102 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TEAD3Q99594 435 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SIRPDQ9H106 197 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ABCB9Q9NP78 766 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 KRT84Q9NSB2 600 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TMEM210A6NLX4 147 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SRRM5B3KS81 715 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 GSC2O15499 205 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 NDUFB3O43676 98 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PRKYO43930 277 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CST4P01036 141 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SELLP14151 372 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 GPM6AP51674 278 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 IL13RA1P78552 427 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PDCD1Q15116 288 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CEP78Q5JTW2 689 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FAHD1Q6P587 224 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 C16orf87Q6PH81 154 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 NRBF2Q96F24 287 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ZNF747Q9BV97 191 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MROQ9BYG7 248 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FAM206AQ9NX38 181 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 COPS3Q9UNS2 423 aa14.61□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PRR32B1ATL7 298 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 IGHV1-69P01742 117 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 MAP2K3P46734 347 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 BPIFB3P59826 476 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 STUMQ69YW2 141 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.59□□□□□ -0.07
NME3-205ENST00000563854 G3V2T6 193 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms