RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ARPC2	O15144	300 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	AKR7A2	O43488	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD17B1	P14061	328 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PAX6	P26367	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD11B1	P28845	292 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GNAL	P38405	381 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC15A1	P46059	708 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE2E1	P51965	193 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A1	P53007	311 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LY6E	Q16553	131 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZTK2	550 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CFHR4	Q92496	578 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RORB	Q92753	470 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	AJUBA	Q96IF1	538 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD6	Q9BV23	337 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TOR3A	Q9H497	397 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQ09	198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		M0R1W7	72 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SOX14	O95416	240 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GAST	P01350	101 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFB7	P17568	137 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ACKR3	P25106	362 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HMGA2	P52926	109 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSM1	Q08AH1	577 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SSX3	Q99909	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MICU1	Q9BPX6	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MED20	Q9H944	212 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SIGLEC5	O15389	551 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PRDX6	P30041	224 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	DCTD	P32321	178 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OPRL1	P41146	370 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CAV3	P56539	151 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	IL5RA	Q01344	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PRDX4	Q13162	271 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MED30	Q96HR3	178 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PGAM5	Q96HS1	289 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10A2	Q9H208	303 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2AT4	A6NND4	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PIN1P1	O15428	100 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ANGPTL7	O43827	346 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CHST1	O43916	411 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RHBDL1	O75783	438 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT36	O76013	467 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ALX3	O95076	343 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	APOC1	P02654	83 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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