RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPX	A8MT69	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BUI4	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R135	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SGCE	O43556	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC14B	O60729	498 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS3	O75911	302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNGR4	O95473	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CD3G	P09693	182 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ARSB	P15848	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB3A	P20336	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ANOS1	P23352	680 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MPZ	P25189	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEA5	P43359	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	INPP1	P49441	399 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	STAR	P49675	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKX	P51817	358 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	EFNB2	P52799	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF13	Q15543	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TGIF1	Q15583	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SGCA	Q16586	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	AQP3	Q92482	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FGGY	Q96C11	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MED30	Q96HR3	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NIN4	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247		E9PLN8	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB27B	O00194	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX2-8	O15522	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	LMX1B	O60663	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAF2	O60831	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CA11	O75493	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	CD74	P04233	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	TCRB	P04435	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	IL5	P05113	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4A-208	ENST00000489247	YES1	P07947	543 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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