RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.49□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CACNG2Q9Y698 323 aa7.49□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PLPP2O43688 288 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 OCM2P0CE71 109 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF1AP19438 455 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PCMT1P22061 227 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 THBS2P35442 1172 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CD200P41217 278 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 GPM6AP51674 278 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 BDH1Q02338 343 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MAB21L1Q13394 359 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MPPED2Q15777 294 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM42Q69YG0 159 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 SPERTQ8NA61 448 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CCL17Q92583 94 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 RDH5Q92781 318 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 UFD1Q92890 307 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 YIPF5Q969M3 257 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ITFG2Q969R8 447 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ITPKCQ96DU7 683 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 RNF170Q96K19 258 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 OPALINQ96PE5 141 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MGLLQ99685 303 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MICU1Q9BPX6 476 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TMED9Q9BVK6 235 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 USF3Q68DE3 2245 aa7.48□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 A6NLC8 198 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF732B4DXR9 585 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 SERPINA3P01011 423 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PSMB9P28065 219 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CRYBB2P43320 205 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PDLIM4P50479 330 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MZT1Q08AG7 82 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2V2Q15819 145 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 NEDD8Q15843 81 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 HFEQ30201 348 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 SHEQ5VZ18 495 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 KRT74Q7RTS7 529 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 WDR86Q86TI4 376 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 PP6455Q8WZ26 134 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 FAM168AQ92567 244 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM203Q969S6 136 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 C10orf35Q96D05 121 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 Q96MF0 132 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 OR14A2Q96R54 314 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 CHST5Q9GZS9 411 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 GCM1Q9NP62 436 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 ABCB9Q9NP78 766 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.47□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.46□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.46□□□□□ -1.21
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 A0A087WXM4 84 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PPK0 400 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM64BA6NI03 449 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 OR5B21A6NL26 309 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 RP2O75695 350 aa7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASQ1-202ENST00000467691 INMTO95050 263 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms