RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CMBLQ96DG6 245 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG12Q9BV10 488 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BQ15 152 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR5O14804 337 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TUSC2O75896 110 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNA6P05013 189 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CELA3AP09093 270 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PGA4P0DJD7 388 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PGA5P0DJD9 388 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GIMD1P0DJR0 217 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CEBPBP17676 345 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA2P20848 420 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FCGR2CP31995 323 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2G2P60604 165 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OTPQ5XKR4 325 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 VITQ6UXI7 678 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MED25Q71SY5 747 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST4Q8NCG5 386 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF128Q8TEB7 428 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 AICDAQ9GZX7 198 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 BRCA2P51587 3418 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF716A6NP11 495 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 HRKO00198 91 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DVL1O14640 695 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB2O95178 105 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 LYL1P12980 280 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DRD1P21728 446 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NPY4RP50391 375 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DPTQ07507 201 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZVU0 165 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF550Q7Z398 422 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MDGA2Q7Z553 956 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 COMMD1Q8N668 190 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF152Q8N8N0 203 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MCHR2Q969V1 340 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf142B7Z368 130 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 C4orf51C9J302 202 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YL77 283 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EPK0 472 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL16O15467 120 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT7O43581 403 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 JTBO76095 146 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PGA3P0DJD8 388 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 THBS4P35443 961 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM33P57088 247 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TFF2Q03403 129 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 AMZ2Q86W34 360 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 STACQ99469 402 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SDF2Q99470 211 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2AG1Q9H205 316 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 LANCL2Q9NS86 450 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB22AQ9UL26 194 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR19A6NJB7 356 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINT1O43278 529 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 AMBPP02760 352 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC3BP05452 202 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00614P0C842 121 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PET100P0DJ07 73 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 MSX1P28360 303 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRA4P48169 554 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DLK1P80370 383 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP8Q13202 625 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 NFATC4Q14934 902 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms