RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA2Q9UM82 520 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-201ENST00000324444 C5orf63A6NC05 138 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 VSTM5A8MXK1 200 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CLDN25C9JDP6 229 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LMX1BO60663 402 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 NRASP01111 189 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HCKP08631 526 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ADRA2CP18825 462 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GCH1P30793 250 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 TFF3Q07654 80 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SPOCK1Q08629 439 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF846Q147U1 533 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM189A2Q15884 450 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM42Q69YG0 159 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ACBD4Q8NC06 268 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LURAP1Q96LR2 239 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SLC22A4Q9H015 551 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GHRLQ9UBU3 117 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PDZD2O15018 2839 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SMIM30A4D0T7 59 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CD300LBA8K4G0 201 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 UBBP0CG47 229 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HTR2CP28335 458 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SSTR2P30874 369 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 TALDO1P37837 337 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FUT6P51993 359 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HAVCR1Q96D42 359 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RADILQ96JH8 1075 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SOX7Q9BT81 388 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HCFC1P51610 2035 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GMDSO60547 372 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM157BP0CG42 384 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ACKR3P25106 362 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CD40P25942 277 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.075e-8■■■■□ 19.5
SYNE4-201ENST00000324444 ETV6P41212 452 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SELENOVP59797 346 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 HES5Q5TA89 166 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GPER1Q99527 375 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CTDSP2O14595 271 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 APOA1P02647 267 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 IGFBP2P18065 325 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 THBS2P35442 1172 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GLRXP35754 106 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RBP2P50120 134 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ATP1B3P54709 279 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PIGCQ92535 297 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 CMBLQ96DG6 245 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 C14orf79Q96F83 325 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 BORCS8Q96FH0 119 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 S100A13Q99584 98 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 GFI1Q99684 422 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 RTTNQ86VV8 2226 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 A6NIN4 97 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM25AB3EWG3 89 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM25CB3EWG5 89 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 FAM25GB3EWG6 89 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-201ENST00000324444 ANOS1P23352 680 aa15.48■□□□□ 0.07
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