RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 OR51F2Q8NH61 342 aa11.09□□□□□ -0.63
UBXN4-201ENST00000272638 STOML3Q8TAV4 291 aa11.09□□□□□ -0.63
UBXN4-201ENST00000272638 ST8SIA2Q92186 375 aa11.09□□□□□ -0.63
UBXN4-201ENST00000272638 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.09□□□□□ -0.63
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0J9YW62 118 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HLA-HP01893 362 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 FAM157BP0CG42 384 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 UBBP0CG47 229 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RAG2P55895 527 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PPA1Q15181 289 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 LYG2Q86SG7 212 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 C5orf49A4QMS7 147 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ARG2P78540 354 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 IKZF1Q13422 519 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TERB2Q8NHR7 220 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00052Q96N35 136 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 VSIG4Q9Y279 399 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TOR1AO14656 332 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HS3ST1O14792 307 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SCGNO76038 276 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV3-19P01714 112 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PTGFRP43088 359 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 MALLQ13021 153 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CLINT1Q14677 625 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CDH26Q8IXH8 852 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RDH5Q92781 318 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 EMC3Q9P0I2 261 aa11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 BPNT1O95861 308 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PSMB6P28072 239 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HOXC12P31275 282 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 MMP16P51512 607 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CMTM3Q96MX0 182 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PCNX3Q9H6A9 2034 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TO15178 435 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 EFNA2O43921 213 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CDC14BO60729 498 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 MED6O75586 246 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CBR3O75828 277 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ACER2Q5QJU3 275 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 OR10D3Q8NH80 312 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CADP27708 2225 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0D9SG52 128 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RRASP10301 218 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RAB6AP20340 208 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TAS2R31P59538 309 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 MICBQ29980 383 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SLC22A25Q6T423 547 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ST7LQ8TDW4 575 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SAP25Q8TEE9 199 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RAB27BO00194 218 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 NRASP01111 189 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 OR5H8P0DN80 308 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 RBP2P50120 134 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 LTC4SQ16873 150 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SLAMF9Q96A28 289 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 NELFAQ9H3P2 528 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 C9orf170A2RU37 121 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HSPB2A8KAH6 182 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ROM1Q03395 351 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HSPB2Q16082 182 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 CLLU1Q5K131 121 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 BEND4Q6ZU67 534 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 GPR137Q96N19 417 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.06□□□□□ -0.64
UBXN4-201ENST00000272638 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms