RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GABRA5P31644 462 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GNALP38405 381 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DDOSTP39656 456 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRAM1Q15629 374 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MOGQ16653 247 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MST1LQ2TV78 715 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 Q499Y3 187 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 AGAP6Q5VW22 663 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZSR3 168 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FTMTQ8N4E7 242 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR8G5Q8NG78 346 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FGGYQ96C11 551 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR14A2Q96R54 314 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MSL2Q9HCI7 577 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM100Q9NV29 134 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPR160Q9UJ42 338 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CENPEQ02224 2701 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PLCE1Q9P212 2302 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPK0 400 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF879B4DU55 563 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 H0YL77 283 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 M0R233 179 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SPRY3O43610 288 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA3P01011 423 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CST4P01036 141 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD8AP01732 235 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DPB1P04440 258 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD2P06729 351 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD36P16671 472 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TGFBR2P37173 567 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF81P51508 661 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MMP15P51511 669 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP10-9P60411 292 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FABP5Q01469 135 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PRDX4Q13162 271 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 INSL4Q14641 139 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR8G1Q15617 311 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CEP78Q5JTW2 689 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZR03 302 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MOB3CQ70IA8 216 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DTX2Q86UW9 622 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PIGCQ92535 297 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NRGNQ92686 78 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM106AQ96A25 262 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CCL19Q99731 98 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TPK1Q9H3S4 243 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPR173Q9NS66 373 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TACC2O95359 2948 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FBN2P35556 2912 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DSCAMO60469 2012 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GABRPO00591 440 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MLNRO43193 412 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GMDSO60547 372 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NRASP01111 189 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TFAP2AP05549 437 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 BMP4P12644 408 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GADD45AP24522 165 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CDKN1AP38936 164 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ALDH3B2P48448 385 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PPOXP50336 477 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.25□□□□□ -1.25
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