RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 LHX9Q9NQ69 397 aa3.42□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.42□□□□□ -1.86
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USP15-218ENST00000552346 NEU3Q9UQ49 428 aa3.42□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 A0A0U1RQV1 116 aa3.41□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.41□□□□□ -1.86
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USP15-218ENST00000552346 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 REM1O75628 298 aa3.41□□□□□ -1.86
USP15-218ENST00000552346 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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USP15-218ENST00000552346 EMC6Q9BV81 110 aa3.41□□□□□ -1.86
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USP15-218ENST00000552346 TFR2Q9UP52 801 aa3.41□□□□□ -1.86
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USP15-218ENST00000552346 C11orf94C9JXX5 98 aa3.4□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 F8VP50 259 aa3.4□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
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USP15-218ENST00000552346 C1orf198Q9H425 327 aa3.39□□□□□ -1.87
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USP15-218ENST00000552346 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 C12orf10Q9HB07 376 aa3.39□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.39□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.39□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.39□□□□□ -1.87
USP15-218ENST00000552346 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.39□□□□□ -1.87
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