RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 B9D1Q9UPM9 204 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 IFITM5A6NNB3 132 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PPM1DO15297 605 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 B3GALT4O96024 378 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 HNF1AP20823 631 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 MMP15P51511 669 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 GPM6AP51674 278 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 POU4F3Q15319 338 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FOXB1Q99853 325 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ADAM10O14672 748 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 C21orf58P58505 322 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 BEX5Q5H9J7 111 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 HES3Q5TGS1 186 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR5M11Q96RB7 305 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 NMES1Q9C002 83 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SIRPB1O00241 398 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ALOX5APP20292 161 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OPRM1P35372 400 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 RAB1AP62820 205 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CLINT1Q14677 625 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ACER2Q5QJU3 275 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR5B21A6NL26 309 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 M0QYG6 137 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FABP6P51161 128 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FAHD1Q6P587 224 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 TGOLN2O43493 480 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 NXPH1P58417 271 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF385BQ569K4 471 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OTOSQ8NHW6 89 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 APH1BQ8WW43 257 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM230Q96A57 120 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf49Q96BT1 292 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 COX7A2P2O60397 106 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 DHRS3O75911 302 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 YIF1AO95070 293 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 S100A8P05109 93 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FGF2P09038 288 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CTRB1P17538 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ACKR3P25106 362 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PAX6P26367 422 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CASP3P42574 277 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PIGPP57054 158 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ASAH1Q13510 395 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SSX2Q16385 188 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 OR51H1Q8NH63 302 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 RND1Q92730 232 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 RAB1CQ92928 201 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ERGIC1Q969X5 290 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SEC22AQ96IW7 307 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 LALBAP00709 142 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 PGA3P0DJD8 388 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 ISL1P61371 349 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 FOXF1Q12946 379 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 MOB3BQ86TA1 216 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 BAGE3Q86Y29 109 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-226ENST00000546160 BAGE2Q86Y30 109 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms