RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530747.5

ARHGEF12-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF12, Length 1,930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-210ENST00000530747 OPN5Q6U736 354 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 EID2Q8N6I1 236 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 IL22RA2Q969J5 263 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 Q96MF0 132 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GNRHR2Q96P88 292 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 IL17FQ96PD4 163 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RBP7Q96R05 134 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 F2RL3Q96RI0 385 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TP53RKQ96S44 253 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SORT1Q99523 831 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CHIAQ9BZP6 476 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADGRL2O95490 1459 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TONSLQ96HA7 1378 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR4C46A6NHA9 309 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 H3BMH7 237 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MPDU1O75352 247 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AGFG2O95081 481 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AOC1P19801 751 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HTR1DP28221 377 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 IL12AP29459 219 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RAB35Q15286 201 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HIST3H3Q16695 136 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FA2HQ7L5A8 372 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LXNQ9BS40 222 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CPVLQ9H3G5 476 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 Q9H8V8 135 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NANOGQ9H9S0 305 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 DMAC2Q9NW81 257 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 V9GYS6 101 aa5.05□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 A0A087WUU8 490 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AIPO00170 330 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TAAR5O14804 337 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FFAR3O14843 346 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GPR42O15529 346 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM189A1O60320 539 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MPC2O95563 127 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GASTP01350 101 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SEMG1P04279 462 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CYP2D6P10635 497 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FSTP19883 344 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MAOAP21397 527 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FASP25445 335 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GLRXP35754 106 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LOXL3P58215 753 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ERVFC1-1P60608 527 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SPHARQ15513 63 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TCTN1Q2MV58 587 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MORN2Q502X0 79 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.04□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms