RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 HSD11B1P28845 292 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GSTT1P30711 240 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OPRL1P41146 370 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 FOXL1Q12952 345 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PRDX4Q13162 271 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 Q6YL49 198 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CPOQ8IVL8 374 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TEX29Q8N6K0 151 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N7P7 452 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 OR8S1Q8NH09 359 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 GIPC3Q8TF64 312 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 THEM6Q8WUY1 208 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SPSB4Q96A44 273 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SLC25A28Q96A46 364 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PGAM5Q96HS1 289 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF488Q96MN9 340 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CHID1Q9BWS9 393 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 SP140LQ9H930 580 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 CMC2Q9NRP2 79 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 C1RLQ9NZP8 487 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 COPS3Q9UNS2 423 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC3-211ENST00000491581 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SRRM5B3KS81 715 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ATP8B1O43520 1251 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GMDSO60547 372 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GLCEO94923 617 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CST1P01037 141 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1-69P01742 117 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 H2BFMP0C1H6 154 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 EPHA2P29317 976 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GRK5P34947 590 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DGUOKQ16854 277 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CEP78Q5JTW2 689 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TEX30Q5JUR7 227 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PRR31Q5SQ13 230 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GPR157Q5UAW9 335 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 C16orf87Q6PH81 154 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PIGCQ92535 297 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ITPKCQ96DU7 683 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 LRP12Q9Y561 859 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC182A6NF36 153 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 IFNL4K9M1U5 179 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 XRCC2O43543 280 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RAP2AP10114 183 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF3P17036 446 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SLC2A5P22732 501 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MTNR1AP48039 350 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RAG2P55895 527 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 DEFA6Q01524 100 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 APOFQ13790 326 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TAF9Q16594 264 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 STUMQ69YW2 141 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 TREML4Q6UXN2 200 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 RORBQ92753 470 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 GAFA1Q96PS6 74 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PKP2Q99959 881 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC3-211ENST00000491581 MEGF11A6BM72 1044 aa7.31□□□□□ -1.24
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