RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 YIPF6Q96EC8 236 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C4orf36Q96KX1 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SAMD8Q96LT4 415 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR22Q99680 433 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KCNS3Q9BQ31 491 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAB33BQ9H082 229 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NEUROG2Q9H2A3 272 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAB18Q9NP72 206 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRSS16Q9NQE7 514 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DCAF16Q9NXF7 216 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NEBP20929 6669 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTPRKQ15262 1439 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0J9YX75 114 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1B0GVG6 124 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARRDC5A6NEK1 342 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOX15O60248 233 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NMT2O60551 498 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MT-ATP6P00846 226 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SERPIND1P05546 499 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTHLHP12272 177 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL3RAP26951 378 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HTR2AP28223 471 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CRABP2P29373 138 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HTR2BP41595 481 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NSG1P42857 185 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NDUFA8P51970 172 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CD164Q04900 197 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GAMTQ14353 236 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF726P1Q15940 193 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q6ZSR6 202 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCXQ7RTU7 201 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TICAM2Q86XR7 235 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AMN1Q8IY45 258 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM123Q8N131 208 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDIK1LQ8N165 341 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MS4A15Q8N5U1 240 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR31Q8NA23 367 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LFNGQ8NES3 379 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR4M2Q8NGB6 313 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR2A1Q8NGT9 310 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 APH1BQ8WW43 257 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 THRSPQ92748 146 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C14orf79Q96F83 325 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BTN2A3PQ96KV6 586 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPP1R36Q96LQ0 422 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UBE2E2Q96LR5 201 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC38A2Q96QD8 506 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MTMR9Q96QG7 549 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MICU1Q9BPX6 476 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q9BRP9 147 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RDH14Q9HBH5 336 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPASTQ9UBP0 616 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR5V1Q9UGF6 321 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM72A0PK05 275 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYCE3A1L190 88 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 H7C1H1 209 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GOSR2O14653 212 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CACNG3O60359 315 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TGFAP01135 160 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SEC11BP0C7V7 166 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNNI3P19429 210 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TEAD1P28347 426 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL12BP29460 328 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATP5DP30049 168 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCK1P35558 622 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAB9AP51151 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SSR4P51571 173 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 XKP51811 444 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IFITM3Q01628 133 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF266Q14584 549 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CDK5R1Q15078 307 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNXAQ16473 311 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NNATQ16517 81 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C1orf185Q5T7R7 199 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UBE2UQ5VVX9 321 aa-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms