RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 COMMD2Q86X83 199 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 SPICQ8N5J4 248 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 YIPF7Q8N8F6 280 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 SPERTQ8NA61 448 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 APH1BQ8WW43 257 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ERGIC1Q969X5 290 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ITPKCQ96DU7 683 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 BEX2Q9BXY8 128 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 OR52A1Q9UKL2 312 aa22.62■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 A6NLC8 198 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC30A6NM36 301 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 SLC16A6O15403 523 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 KRT8P05787 483 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 CD80P33681 288 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 GNALP38405 381 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LCN2P80188 198 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF91Q05481 1191 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 TP53I3Q53FA7 332 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 DMRTC1Q5HYR2 192 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LIPNQ5VXI9 398 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PIGCQ92535 297 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 AMBNQ9NP70 447 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.61■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ERICH4A6NGS2 130 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 METTL15A6NJ78 407 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PPIAL4DF5H284 164 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 CLIC3O95833 236 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 CST4P01036 141 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 IRF2P14316 349 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 EGR1P18146 543 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 THBS2P35442 1172 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF154Q13106 437 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 BCL2L15Q5TBC7 163 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ELMOD2Q8IZ81 293 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL36Q8N4N3 616 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 OR1M1Q8NGA1 313 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 RORBQ92753 470 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LGALS12Q96DT0 336 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 MOB1AQ9H8S9 216 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 RNF7Q9UBF6 113 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB10Q9UN67 800 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.6■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GTI1 187 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf80F5H4A9 247 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF404Q494X3 552 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LYPD2Q6UXB3 125 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB108BQ8NET1 73 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.59■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY10O00398 339 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 FAM157CP0CG43 387 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 FAHP16930 419 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 PSMB10P40306 273 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ISL1P61371 349 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ODF4Q2M2E3 257 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 OR5P3Q8WZ94 311 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 RDH12Q96NR8 316 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.58■■□□□ 1.21
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 H3BSH0 61 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 AVPP01185 164 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 WNT2P09544 360 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 MAP2K3P46734 347 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 FTMTQ8N4E7 242 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 GNG8Q9UK08 70 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.57■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 SVEP1Q4LDE5 3571 aa22.56■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 ANXA2P2A6NMY6 339 aa22.56■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TPGS1-201ENST00000359315 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms