RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEB3O15480 346 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPV17P39210 176 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSG7Q13046 419 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTS2BQ765I0 119 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHISA3A0PJX4 238 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1B1O43704 296 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRASP01111 189 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF224P0DH78 156 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX6P35712 828 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMD7P51665 324 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AS1Q8N127 324 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGTQ969N2 578 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA10Q9NS85 328 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP13Q9UII6 198 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM30A4D0T7 59 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM64BA6NI03 449 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC2LP0C7M8 214 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TECTBQ96PL2 329 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR173Q9NS66 373 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCF6A8MYZ5 107 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS44E7EML9 344 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 GMDSO60547 372 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CST4P01036 141 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF250P15622 560 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFBP2P18065 325 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 KITLGP21583 273 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 BDKRB2P30411 391 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RORCP51449 518 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP78Q5JTW2 689 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASPHD2Q6ICH7 369 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRTM1Q86UE6 522 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF442Q9H7R0 627 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF850A8MQ14 1090 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB108AA8MXU0 73 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCKP08631 526 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATF1P18846 271 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGUOKQ16854 277 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCXD3Q63HM9 321 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOB3CQ70IA8 216 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CROCCP3Q8IVE0 287 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKAIN3Q8N8D7 197 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51A2Q8NGJ7 313 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A46Q96AG3 418 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 V9GY05 133 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHISA9B4DS77 424 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCR1O76036 304 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDX4Q13162 271 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLT8D1Q68CQ7 371 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM42Q69YG0 159 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF529Q6P280 563 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPC1Q9Y5U8 109 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALX3O95076 343 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKACBP22694 351 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2V2Q15819 145 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOGQ16653 247 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYT3Q9BQG1 590 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCB9Q9NP78 766 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO18BQ8IUG5 2567 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOTOA8MTQ0 251 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIAH2O43255 324 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-13P01766 116 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADRA2CP18825 462 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAV3P56539 151 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10A3P58181 314 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDI2Q5TDH0 399 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8G5Q8NG78 346 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPRL2Q8WTW4 380 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPSB1Q96BD6 273 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM100Q9NV29 134 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR160Q9UJ42 338 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA6P23280 308 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALKBH6Q3KRA9 238 aa23.48■■□□□ 1.35
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