RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	BI4	P03879	638 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	CHS1	P08004	1131 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.53	□□□□□ -0.56	not detected
DDR2	YOL052C-A	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	YJR054W	P47114	497 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	YGR035C	P53222	116 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	CDD1	Q06549	142 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	NUR1	Q12066	484 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	YOR022C	Q12204	715 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	RMP1	Q12530	201 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	BI3	Q9ZZW7	517 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDR2	YOL052C-A	BIO2	P32451	375 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	NFU1	P32860	256 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SAK1	P38990	1142 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GEM1	P39722	662 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	ESL1	P40456	1118 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	ASG1	P40467	964 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SPO74	P45819	413 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	BRO1	P48582	844 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YPL034W	Q03083	165 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	JIP3	O13555	125 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	CDC8	P00572	216 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	PDR1	P12383	1068 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	VPS3	P23643	1011 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GYP6	P32806	458 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	AVT3	P36062	692 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	TBS1	P38114	1094 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	POA1	P38218	177 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	URH1	Q04179	340 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SDH5	Q08230	162 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	TRE1	Q08919	783 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	VBA3	P25594	458 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MRP4	P32902	394 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	LTV1	P34078	463 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	VBA5	P36172	582 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	BRL1	P38770	471 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	DSE1	P40077	573 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SNZ3	P43545	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YFL040W	P43562	540 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SNZ2	P53824	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	AIM41	Q12032	185 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	PMS1	P14242	873 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	CSE2	P33308	149 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	AGP2	P38090	596 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	STB4	P50104	949 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YMR187C	Q03236	431 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	FRE1	P32791	686 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MMS21	P38632	267 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	POL31	P46957	487 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	STP1	Q00947	519 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	IVY1	Q04934	453 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	CIR2	Q08822	631 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	PUT4	P15380	627 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SFL1	P20134	766 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SEG2	P34250	1132 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	HEL1	P36113	551 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MRPL7	P36519	292 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YBL036C	P38197	257 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	TMN3	P40071	706 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YNL115C	P53925	644 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SKY1	Q03656	742 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	ARO80	Q04052	950 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	TDA9	Q04545	1251 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	ESC8	Q08119	714 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GAC1	P28006	793 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	SLX1	P38324	304 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	END3	P39013	349 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	INP52	P50942	1183 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YNL108C	P53929	270 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	MUB1	Q03162	620 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GYL1	Q04322	720 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	YDR278C	Q05612	105 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	AIM39	Q08223	395 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	REC8	Q12188	680 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDR2	YOL052C-A	GAL80	P04387	435 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58

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