RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	IDI1	P15496	288 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SPO16	P17122	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SAN1	P22470	610 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MLS1	P30952	554 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RAD16	P31244	790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PAH1	P32567	862 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AFG2	P32794	780 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SDS22	P36047	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HSL7	P38274	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PES4	P39684	611 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RIC1	P40395	1056 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ERR3	P42222	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	VPS53	P47061	822 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PPT1	P53043	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AIM14	P53109	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MRPL19	P53875	158 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TAF11	Q04226	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	IRC3	Q06683	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SOG2	Q08817	791 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ACE2	P21192	770 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PER1	P25625	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	AFR1	P33304	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	OAF3	P36023	863 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ALG3	P38179	458 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HXT7	P39004	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SAW1	P39735	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	JEM1	P40358	645 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	FET4	P40988	552 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SMK1	P41808	388 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SLS1	P42900	643 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	BNA2	P47125	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NSE5	Q03718	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ADY3	Q07732	790 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MDM38	Q08179	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YIG1	Q08956	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	LAP2	Q10740	671 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ENV7	Q12003	364 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PTC5	Q12511	572 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MRP10	O75012	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RED1	P14291	827 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SLC1	P33333	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	CCZ1	P38273	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	UBS1	P38290	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	LEM3	P42838	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YJR124C	P47159	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	GUP1	P53154	560 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	BTN2	P53286	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ARA2	Q04212	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HSP42	Q12329	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MDL2	P33311	773 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YIL166C	P40445	542 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	GYP7	P48365	746 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ENV11	P53246	860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YAP1802	P53309	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	CTF4	Q01454	927 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	MEC3	Q02574	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	PKH1	Q03407	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YHM2	Q04013	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	YKU80	Q04437	629 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	HIM1	Q06674	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RPS1B	YML063W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected

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