RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W THI73Q07904 523 aa5.7□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W PEX1P24004 1043 aa5.69□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W HIR1P32479 840 aa5.69□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YJR096WP47137 282 aa5.69□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa5.69□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W CRP1P38845 465 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W FMO1P38866 432 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W GZF3P42944 551 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W STB4P50104 949 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W UBA2P52488 636 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W MTL1P53214 551 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W SSL2Q00578 843 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W UME1Q03010 460 aa5.68□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W HIS7P33734 552 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YKR075CP36155 307 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W TDA3P38758 523 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W BFA1P47113 574 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W MUK1Q02866 612 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W TMN2Q04562 672 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W NUP145P49687 1317 aa5.67□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W PET127P32606 800 aa5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W TYS1P36421 394 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W NUG1P40010 520 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W GET2P40056 285 aa5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W SDS3P40505 327 aa5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W APM4Q99186 491 aa5.66□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W ERG20P08524 352 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W SWI6P09959 803 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W MVD1P32377 396 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W PRP19P32523 503 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YHR202WP38887 602 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W STU2P46675 888 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YGR153WP48238 217 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W FHN1P53279 174 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W HFD1Q04458 532 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W THI22Q06490 572 aa5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
YLL047WYLL047W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.64□□□□□ -1.51not detected
YLL047WYLL047W ERG6P25087 383 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W SEC6P32844 805 aa5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YPT7P32939 208 aa5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W QRI1P43123 477 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W RSC8P43609 557 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YMR206WQ03695 313 aa5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W IRC10Q08118 586 aa5.64□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PRP28P23394 588 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W DID4P36108 232 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W BIT2P38346 545 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PCL5P38794 229 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W MNN11P46985 422 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YGR237CP50089 785 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W GPG1P53130 126 aa5.63□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W UBP12P39538 1254 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PIG2P40187 538 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ARG2P40360 574 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W COX18P53239 316 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YMR210WQ03649 449 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W VHS3Q08438 674 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W POM34Q12445 299 aa5.62□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YKU70P32807 602 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W MTH1P35198 433 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PHO11P35842 467 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PHO12P38693 467 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W SFB3P38810 929 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.61□□□□□ -1.51not detected
YLL047WYLL047W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W BIT61P47041 543 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ATG4P53867 494 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ECM9Q02202 377 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W YLR407WQ06070 228 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W HFI1Q12060 488 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ZRT2Q12436 422 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W ECM3Q99252 613 aa5.61□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W KIN82P25341 720 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W OAF3P36023 863 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W HXT6P39003 570 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W HXT7P39004 570 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W NDC80P40460 691 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W GPP1P41277 250 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W GND2P53319 492 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PPN1Q04119 674 aa5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W DMC1P25453 334 aa5.59□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W BCS1P32839 456 aa5.59□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W TAF3Q12297 353 aa5.59□□□□□ -1.51
YLL047WYLL047W TAD3Q9URQ3 322 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19 ms