RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 KINO60870 393 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA1Q92805 767 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 TNRQ92752 1358 aa20.34■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 ERLIN2O94905 339 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 TXLNAP40222 546 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 BRD3Q15059 726 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 DDX11Q96FC9 970 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.33■□□□□ 0.85
GLIS1-202ENST00000628545 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 RESTQ13127 1097 aa20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 MIEF2Q96C03 454 aa20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CHL1O00533 1208 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 WDR24Q96S15 920 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CFAP45Q9UL16 551 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 KLHL33A6NCF5 533 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 PPFIA4O75335 1185 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 INHBEP58166 350 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 STK3Q13188 491 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 USP8P40818 1118 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 HDXQ7Z353 690 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GNG11P61952 73 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 TICAM2Q86XR7 235 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CNNM3Q8NE01 707 aa20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 KCNB2Q92953 911 aa20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ZSCAN12O43309 604 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 MCM10Q7L590 875 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 BRF1Q92994 677 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 PHACTR2O75167 634 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 NECTIN1Q15223 517 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 JAK2O60674 1132 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 LIG3P49916 1009 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GBP6Q6ZN66 633 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 H3BQV1 296 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 IFFO2Q5TF58 517 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 DHX58Q96C10 678 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 FAM107BQ9H098 131 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 H0YHG0 523 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC102AQ96A19 550 aa20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GLIS1-202ENST00000628545 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
GLIS1-202ENST00000628545 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.26■□□□□ 0.83
GLIS1-202ENST00000628545 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GLIS1-202ENST00000628545 FSIP1Q8NA03 581 aa20.26■□□□□ 0.83
GLIS1-202ENST00000628545 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms