RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	SPAG1	Q07617	926 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	WTAP	Q15007	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	ABCC4	O15439	1325 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	SLC5A1	P13866	664 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	ADGRL2	O95490	1459 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	EBAG9	O00559	213 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	EYA1	Q99502	592 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	PTPRT	O14522	1441 aa		12.77	□□□□□ -0.36
BECN1-222	ENST00000617806	TFCP2	Q12800	502 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	HDX	Q7Z353	690 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	VGLL3	A8MV65	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	FANCC	Q00597	558 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	NPAT	Q14207	1427 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	JAK2	O60674	1132 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	RTN1	Q16799	776 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ME3	Q16798	604 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	RMND1	Q9NWS8	449 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	AOX1	Q06278	1338 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KRT86	O43790	486 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	INCENP	Q9NQS7	918 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KDM6B	O15054	1643 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ELP1	O95163	1332 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KDM5C	P41229	1560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM75P	A6NK02	468 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	OPA1	O60313	960 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ZEB2	O60315	1214 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	STAT6	P42226	847 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	AMPD3	Q01432	767 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KIAA0556	O60303	1618 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	NR1I2	O75469	434 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF76	P36508	570 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TUBB4B	P68371	445 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KIF5A	Q12840	1032 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	CALML4	Q96GE6	196 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	CHMP4BP1	P59074	171 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ABCC1	P33527	1531 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	TACC1	O75410	805 aa		12.74	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	FLT4	P35916	1363 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	KRT83	P78385	493 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	UBXN1	Q04323	297 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	ATP2B3	Q16720	1220 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.73	□□□□□ -0.37	2e-6	■■■■■ 182.2
BECN1-222	ENST00000617806	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	BMP15	O95972	392 aa		12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
BECN1-222	ENST00000617806	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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