RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RNF8O76064 485 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R2P41236 205 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 BIN1O00499 593 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 INF2Q27J81 1249 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 USP48Q86UV5 1035 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC63Q8NA47 563 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NESP48681 1621 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CNGA4Q8IV77 575 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM47Q96LD4 638 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 UBA7P41226 1012 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IGF1RP08069 1367 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IQGAP2Q13576 1575 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 BICDL2A1A5D9 508 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCT6BQ92526 530 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RAD50Q92878 1312 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ATP2C2O75185 946 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MYL6BP14649 208 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CRCPO75575 148 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 INPP1P49441 399 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TNNC1P63316 161 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PRAM1Q96QH2 718 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RTL1A6NKG5 1358 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 INPP5BP32019 993 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ZEB2O60315 1214 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SLC8A3P57103 927 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 WHAMMQ8TF30 809 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PODNQ7Z5L7 613 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 STAT6P42226 847 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 METTL24Q5JXM2 366 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 OPTNQ96CV9 577 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 BICD1Q96G01 975 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PSMA7O14818 248 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MYO1BO43795 1136 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM14Q14142 442 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IQCDQ96DY2 449 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PCK1P35558 622 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CUL4BQ13620 913 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SMC5Q8IY18 1101 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 STK24Q9Y6E0 443 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TMX3Q96JJ7 454 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 KRT3P12035 628 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM27P14373 513 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A1P13866 664 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 GFAPP14136 432 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRT-209ENST00000612229 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms