RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 RBCK1Q9BYM8 510 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PP64 1363 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 NPR3P17342 541 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2IP78347 998 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF14Q5TI25 921 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP10Q9P2G4 905 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 DPH6Q7L8W6 267 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 IP6K1Q92551 441 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 ARMC5Q96C12 935 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1024Q9UPX6 916 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS12O14924 1447 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R2N6 131 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 WEE1P30291 646 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE3BQ13370 1112 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF511Q8NB15 262 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 CITED4Q96RK1 184 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 SENP2Q9HC62 589 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP12Q02952 1782 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD62A6NC57 917 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM13AO94988 1023 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FBLN1P23142 703 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 AMPHP49418 695 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PANK3Q9H999 370 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CTHP32929 405 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAM32Q8TC27 787 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT3Q9UH03 358 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 SLIT3O75094 1523 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 EXOC5O00471 708 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF20Q5VTR2 975 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 HELQQ8TDG4 1101 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 GLI3P10071 1580 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCA3Q99758 1704 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 SFI1A8K8P3 1242 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TREHO43280 583 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 WIPF1O43516 503 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXJ1Q92949 421 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 HINFPQ9BQA5 517 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TGIF2Q9GZN2 237 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CRB1P82279 1406 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXC9P31274 260 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 USP4Q13107 963 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 DDB1Q16531 1140 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM182BQ5T319 152 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TMC7Q7Z402 723 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 KIFC2Q96AC6 838 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PIK3C2AO00443 1686 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFB5O43674 189 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 VEGFBP49765 207 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-216ENST00000590105 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms