RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 FRMD6Q96NE9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SLC30A3Q99726 388 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 BACH2Q9BYV9 841 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 EFCC1Q9HA90 598 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 MMP20O60882 483 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CD33P20138 364 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 VEGFBP49765 207 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 OR13H1Q8NG92 308 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 PMEPA1Q969W9 287 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 AK5Q9Y6K8 562 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 MADDQ8WXG6 1647 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K6O95382 1288 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 FGFR3P22607 806 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 IRS1P35568 1242 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 MLECQ14165 292 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 PI16Q6UXB8 463 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 RARAP10276 462 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 NFKB1P19838 968 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CES1P23141 567 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CTBSQ01459 385 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 PHF24Q9UPV7 400 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 ATP10AO60312 1499 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SV2AQ7L0J3 742 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 NPHS2Q9NP85 383 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SPG7Q9UQ90 795 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 GPR25O00155 361 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 C2CD2LO14523 706 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 GIPC1O14908 333 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 TOM1O60784 492 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 CTSHP09668 335 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 SOX18P35713 384 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 BHMTQ93088 406 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf37Q96NL8 207 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PNMA5Q96PV4 448 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 CDC14CA4D256 554 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 KIF4AO95239 1232 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 C12orf49Q9H741 205 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PRXQ9BXM0 1461 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PLCH2O75038 1416 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PP55 124 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PSAPP07602 524 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 BCO2Q9BYV7 579 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 EDN3P14138 238 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 NRLP54845 237 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 PLAURQ03405 335 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 GAS6Q14393 721 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 GRM2Q14416 872 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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