RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 HAND2P61296 217 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCIRG1Q13488 830 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 XAGE2Q96GT9 111 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 GORABQ5T7V8 394 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAPPAQ13219 1627 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNS2Q63HR2 1409 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXP2O15409 715 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 EVA1CP58658 441 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CBX8Q9HC52 389 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASHC4Q2M389 1173 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG3Q9NT62 314 aa23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPTP24298 496 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZAP70P43403 619 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLAIN2Q9P270 581 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIGBQ92521 554 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHL34Q8N239 644 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP28Q96RU2 1077 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFAP45Q9UL16 551 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 HLFQ16534 295 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGAP02671 866 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087WWV3 80 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.47■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.47■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTGS1P23219 599 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 GREM2Q9H772 168 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSF1RP07333 972 aa23.45■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF165P49910 485 aa23.45■■□□□ 1.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPEF2Q9C093 1822 aa23.45■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCAMP43121 646 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 METTL24Q5JXM2 366 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITGA6P23229 1130 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP2B3Q16720 1220 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSC1Q92574 1164 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRC1O43663 620 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM5Q9C035 493 aa23.43■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPAA1O43292 621 aa23.42■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANTXR2P58335 489 aa23.42■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 TICAM2Q86XR7 235 aa23.42■■□□□ 1.34
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