RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556240.1

GPHN-212, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 404 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-212ENST00000556240 C8orf34Q49A92 452 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 CEP135Q66GS9 1140 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 EDEM1Q92611 657 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 SPACA7Q96KW9 195 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.84□□□□□ -1.31
GPHN-212ENST00000556240 H3BRB1 525 aa6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ZBTB39O15060 712 aa6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ICMTO60725 284 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 WISP1O95388 367 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 NPR3P17342 541 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CDC27P30260 824 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CDC25BP30305 580 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 SSTR4P31391 388 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 MTMR3Q13615 1198 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 SLC51AQ86UW1 340 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ATCAYQ86WG3 371 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 PMEPA1Q969W9 287 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 RAXQ9Y2V3 346 aa6.82□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 FAM177BA6PVY3 158 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 NDUFB5O43674 189 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 PDGFAP04085 211 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 NEFLP07196 543 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ACAD11Q709F0 780 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ELP3Q9H9T3 547 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.81□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 SERPINB4P48594 390 aa6.8□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CEP41Q9BYV8 373 aa6.8□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.8□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 STOML1Q9UBI4 398 aa6.8□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 GSC2O15499 205 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 KIF4AO95239 1232 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 IGLV1-40P01703 118 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 KCNA1Q09470 495 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 PDE3BQ13370 1112 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 POLIQ9UNA4 740 aa6.79□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 FSCN2O14926 492 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 EPHA1P21709 976 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 CD97P48960 835 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 XKR5Q6UX68 686 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 PBX4Q9BYU1 374 aa6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GPHN-212ENST00000556240 TM4SF5O14894 197 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 PTPRAP18433 802 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CES1P23141 567 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 MCTP1Q6DN14 999 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CEP120Q8N960 986 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TMC1Q8TDI8 760 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CITED4Q96RK1 184 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 PHACTR2O75167 634 aa6.76□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 TGFB1P01137 390 aa6.76□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 UVSSAQ2YD98 709 aa6.76□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.76□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.76□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 FZD6O60353 706 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 ADAM11O75078 769 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 COBLO75128 1261 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 LCE3BQ5TA77 95 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 ADAM19Q9H013 955 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 CNTN3Q9P232 1028 aa6.75□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.74□□□□□ -1.33
GPHN-212ENST00000556240 H3BRJ5 948 aa6.74□□□□□ -1.33
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